狗的大便有哪些细菌？
据我了解，有些细菌的基因组序列人类已经做了，但是由于检测方法的限制（毕竟不是人体常规菌群）不能拿给普通人看，但是可以给科研工作者参考。 比如最近发表的文章“Fecal metagenome sequencing reveals a dynamic microbial landscape in dogs”就测了42个犬粪便样本的宏基因组。 这篇文章把每个样本里的菌都分了类，还分析了不同样本间的差别（差异显著性）。 结果在100%的显著性水平上，发现了687个物种的差异，减少到98%时只有5个，再减少到95%就只有2个了——犬大便里的真菌和细菌群落的结构和功能是多么的复杂和丰富多彩啊！ 不过研究也发现，尽管这些微生物之间相互影响、共同进化，但它们各自对营养利用的偏好性却很差，说明它们的食物来源是广泛且交叉的。 这篇论文测的是狗粪便里的微生物，当然还可以测呕吐物里的、口水里的甚至鼻屎里的……如果测这些分泌物里微生物的全基因组序列（如RNA-seq或者WGS）还能进一步分析这些微生物的代谢能力（基因表达能力），进而判断这些微生物在宿主营养代谢中的角色(有文章做过人和胃肠道感染模型的代谢组学分析，即测了代谢途径还分析了微生物群落结构，很有意思)。
然而全基因组测序成本高昂，目前只能研究少数样品，而宏基因组测序虽然能初步评估代谢能力，却不能直接看到基因组序列信息。 想要看看细菌/真菌直接产生的化学物质（代谢产物）以及这些物质在肠道内的变化情况还需要做进一步的分析和实验。 总之对消化道的微生物生态的研究正蓬勃发展，希望我的回答对你有所帮助～